Y-хромосома – найкоротша із хромосом. 22 з 23 пар людських хромосом приблизно однакові за обсягом своєї генетичної інформації, і тільки остання, 23 пара, яка визначає стать, порушує цю розмірність. Y-хромосома, що містить гени, які кодують розвиток чоловічих статевих ознак, набагато менша за обсягом, ніж Х-хромосома, яка йде з нею в парі (за чоловічу стать відповідає комбінація хромосом ХY, а за жіночу – ХХ).